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　　SnapGene是一款非常專業(yè)的分子生物學(xué)分析軟件。它的功能十分強(qiáng)大，為用戶提供完善的計(jì)劃，可視化和記錄您的日常分子生物學(xué)程序的解決方案，節(jié)省了大量的時(shí)間和金錢(qián)，容易操作的可視化和模擬，該版本內(nèi)置破解補(bǔ)丁，用戶破解之后，可永久免費(fèi)使用。

【功能特點(diǎn)】

　　成對(duì)對(duì)齊：可以通過(guò)局部，全局或半全局比對(duì)來(lái)分析成對(duì)的DNA或蛋白質(zhì)序列。

　　從Ensembl導(dǎo)入：現(xiàn)在可以將來(lái)自Ensembl基因組瀏覽器的基因或轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)直接導(dǎo)入SnapGene。

　　定向TOPO?克隆：一個(gè)新的界面可以模擬定向TOPO?克隆到拓?fù)洚悩?gòu)酶激活的載體中。

　　靈活對(duì)齊參考：與參考DNA序列比對(duì)的界面已得到增強(qiáng)。各種顯示選項(xiàng)的控件更加直觀，并且可以將比對(duì)限制在參考序列的指定鏈或區(qū)域內(nèi)。

　　可拖動(dòng)的不對(duì)齊端：對(duì)于已與參考DNA序列部分比對(duì)的序列，現(xiàn)在可以將未比對(duì)的末端部分拖出并可視化。

　　AnzaTM酶：Thermo Fisher（Invitrogen）的AnzaTM酶系統(tǒng)已整合到SnapGene的酶數(shù)據(jù)庫(kù)中。

　　DNA到蛋白質(zhì)的比對(duì)轉(zhuǎn)換：可以翻譯DNA比對(duì)的選定區(qū)域以產(chǎn)生相應(yīng)的蛋白質(zhì)比對(duì)。

　　比對(duì)cDNA的內(nèi)含子注釋：當(dāng)cDNA與參考基因組DNA序列比對(duì)時(shí)，該cDNA可用于創(chuàng)建一個(gè)特征，其中的缺口被注釋為內(nèi)含子。

【軟件特色】

　　一、想象

　　1、DNA可視化

　　查看DNA序列的多個(gè)視圖。

　　地圖 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 歷史

　　自定義酶位點(diǎn)，特征，引物，ORF，DNA顏色等的顯示。地圖可以是圓形或線性格式。

　　使用雙鏈模式查看酶位點(diǎn)，具有翻譯，引物和DNA顏色的特征。單鏈模式顯示具有彩色特征的緊湊概覽。

　　從一系列酶組中選擇。剪切網(wǎng)站可以顯示為數(shù)字或行，按名稱或頻率排序。

　　按名稱，位置，大小，顏色，方向性或類型對(duì)帶注釋的要素列表進(jìn)行排序。復(fù)選框在緊湊或完全展開(kāi)的顯示之間切換。

　　按名稱，長(zhǎng)度，顏色，結(jié)合位點(diǎn)，方向性或解鏈溫度對(duì)雜交引物列表進(jìn)行排序。復(fù)選框在緊湊或完全展開(kāi)的顯示之間切換。

　　查看DNA構(gòu)建體的自動(dòng)生成的圖形歷史記錄。祖先序列可以作為單獨(dú)的文件恢復(fù)

　　2、大序列支持

　　瀏覽染色體大小序列。

　　查看 · 搜索 · 縮放

　　利用SnapGene的高效數(shù)據(jù)處理功能，掃描具有數(shù)千種注釋功能的大型DNA序列。

　　使用專有的MICA算法立即在染色體內(nèi)找到序列。

　　使用多功能控件調(diào)整縮放系數(shù)和顯示區(qū)域。

　　3、蛋白質(zhì)可視化

　　查看蛋白質(zhì)序列的多個(gè)視圖。

　　地圖 · 序列 · 屬性 · 特征 · 歷史

　　自定義區(qū)域，站點(diǎn)，鍵和序列顏色的顯示。

　　使用具有相關(guān)特征的1-或3個(gè)字母的氨基酸代碼查看蛋白質(zhì)序列。

　　查看蛋白質(zhì)的分子量，消光系數(shù)，等電點(diǎn)和氨基酸組成。可以對(duì)蛋白質(zhì)的選定部分進(jìn)行相同的分析。

　　按名稱，位置，大小，顏色或類型對(duì)帶注釋的功能列表進(jìn)行排序。復(fù)選框在緊湊或完全展開(kāi)的顯示之間切換。

　　查看自動(dòng)生成的蛋白質(zhì)序列圖形歷史記錄。祖先蛋白質(zhì)或DNA序列可以作為單獨(dú)的文件再生。

　　4、直觀的序列編輯

　　輕松編輯DNA和蛋白質(zhì)序列。

　　標(biāo)準(zhǔn)編輯 · DNA結(jié)束

　　進(jìn)行插入，刪除，替換和大小寫(xiě)更改。復(fù)制并粘貼序列時(shí)，會(huì)自動(dòng)傳輸功能。

　　編輯線性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。

　　5、序列顏色編碼

　　將選定的DNA或氨基酸序列設(shè)置為十種顏色之一。

　　給兩條DNA鏈或蛋白質(zhì)序列著色。顏色在Map和Sequence視圖中都可見(jiàn)。

　　6、特征注釋

　　自動(dòng)注釋常用功能，或手動(dòng)注釋新功能。

　　自動(dòng)特征檢測(cè) · 手動(dòng)特征注釋

　　使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫(kù)查找DNA序列中的常見(jiàn)特征。您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫(kù)中。

　　選擇DNA或蛋白質(zhì)序列的一部分，并使用靈活的GenBank兼容控件注釋特征。

　　二、模擬

　　1、限制性站點(diǎn)指標(biāo)

　　確認(rèn)限制性網(wǎng)站適合克隆。

　　獨(dú)特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性質(zhì)

　　以粗體顯示獨(dú)特的限制性位點(diǎn)，或選擇自動(dòng)定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。

　　不要被愚弄，因?yàn)橄拗菩晕稽c(diǎn)被Dam，Dcm或EcoKI甲基化阻斷。SnapGene將自動(dòng)用星號(hào)標(biāo)記該站點(diǎn)。

　　利用工具提示來(lái)避免有問(wèn)題的限制網(wǎng)站。

　　2、限制性克隆

　　可視化克隆過(guò)程的所有方面。

　　如果您已經(jīng)考慮過(guò)程，則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過(guò)程存在設(shè)計(jì)缺陷，則可以捕獲并糾正錯(cuò)誤。

　　3、PCR

　　模擬標(biāo)準(zhǔn)PCR。

　　使用您自己的引物，或要求SnapGene自動(dòng)設(shè)計(jì)引物。產(chǎn)品文件在其歷史記錄中存儲(chǔ)模板和引物。

　　4、重疊延伸PCR

　　通過(guò)重疊延伸PCR融合片段

　　最多可組裝八個(gè)碎片。選擇要連接的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。

　　5、引物定向誘變

　　使用誘變引物進(jìn)行定點(diǎn)誘變。

　　選擇誘變引物，按下按鈕查看修飾的質(zhì)粒。歷史顏色突出了突變。

　　6、網(wǎng)關(guān)？克隆

　　模擬網(wǎng)關(guān)？ BP克隆或LR克隆，或兩者在同一時(shí)間。

　　為方便起見(jiàn)，提供了常見(jiàn)的供體向量和目的向量。選擇要組裝的片段，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。

　　7、吉布森大會(huì)？

　　通過(guò)融合多達(dá)八個(gè)片段或通過(guò)將多達(dá)八個(gè)片段插入向量來(lái)模擬Gibson Assembly。Gibson Assembly是一種流行的無(wú)縫克隆方法。

　　選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。線性化的載體可以通過(guò)酶消化或反向PCR產(chǎn)生。

　　8、IN-FUSION ?克隆

　　通過(guò)在向量中插入最多八個(gè)片段來(lái)模擬Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一種非常通用的方法，可用于創(chuàng)建無(wú)縫基因融合。

　　選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。線性化的載體可以通過(guò)酶消化或反向PCR產(chǎn)生。

　　9、TA和GC克隆

　　通過(guò)TA或GC克隆捕獲PCR產(chǎn)物。

　　選擇傳統(tǒng)的TA克隆或高效GC克隆。

　　為方便起見(jiàn)，提供了常見(jiàn)的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。

　　10、退火Oligos

　　退火兩個(gè)寡核苷酸形成雙鏈產(chǎn)物。

　　使用簡(jiǎn)單的控件添加突出限制克隆。

　　三、避免錯(cuò)誤

　　使用SnapGene，確保構(gòu)造符合您的要求，并確認(rèn)您獲得了所需的序列。

　　1、閱讀基因融合的框架

　　確保構(gòu)造中的已轉(zhuǎn)換要素符合框架。

　　鏈接翻譯 · 警告信息

　　使用“序列”視圖可以快速查看兩個(gè)已翻譯的要素是否在框架中。如果是這樣，翻譯鏈接在同一行。如果不是，則翻譯在單獨(dú)的行上。

　　2、與參考序列對(duì)齊

　　使用強(qiáng)大的對(duì)齊工具檢查實(shí)際構(gòu)造是否與模擬構(gòu)造匹配。

　　地圖概述 · 序列詳細(xì)信息

　　請(qǐng)參閱對(duì)齊序列與參考序列匹配的位置的概述，以及存在差異的位置。

　　四、自動(dòng)錄制

　　SnapGene自動(dòng)記錄操作以創(chuàng)建圖形歷史記錄，并將祖先結(jié)構(gòu)存儲(chǔ)在最終文件中。

　　1、全面的“撤銷(xiāo)”能力

　　幾乎撤消任何操作。

　　不要害怕嘗試使用SnapGene文件 - 回溯您的步驟很容易。

　　2、歷史和嵌入式祖先

　　查看構(gòu)造的圖形歷史記錄。

　　單擊操作以突出顯示親本和產(chǎn)物序列的相關(guān)部分，或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。

　　單擊歷史記錄樹(shù)中的祖先以重新生成該祖先序列文件，包括其注釋和克隆歷史記錄。

　　3、歷史色彩

　　使用可選的歷史記錄顏色來(lái)標(biāo)識(shí)序列的最新更改。

　　詳細(xì)了解構(gòu)建體的組裝方式，包括結(jié)扎的粘性末端。

　　五、擁有你的數(shù)據(jù)

　　SnapGene允許您根據(jù)需要閱讀和共享文件，同時(shí)保持對(duì)數(shù)據(jù)的完全控制。

　　1、安全文件管理

　　將SnapGene文件保存在所需的位置。

　　使用熟悉的安全操作系統(tǒng)來(lái)存儲(chǔ)和整理SnapGene文件。

　　2、從其他格式導(dǎo)入

　　閱讀許多常見(jiàn)的文件格式。

　　不僅可以導(dǎo)入DNA序列，還可以導(dǎo)入注釋和注釋。我們將繼續(xù)開(kāi)發(fā)進(jìn)口商，以確保您不會(huì)被鎖定為專有文件格式。

　　3、導(dǎo)出為標(biāo)準(zhǔn)格式

　　將序列，地圖或凝膠圖像轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)格式，以便與其他軟件一起使用。

　　將序列導(dǎo)出為GenBank或FASTA格式。將地圖或模擬瓊脂糖凝膠導(dǎo)出為常見(jiàn)的圖像格式。

　　4、使用SnapGene Viewer共享數(shù)據(jù)

　　將SnapGene格式的文件發(fā)送給可以下載免費(fèi)SnapGene Viewer的同事或客戶。

　　只需將文件與鏈接一起發(fā)送到SnapGene Viewer即可。收件人將能夠看到地圖，序列和注釋，就像在完整的SnapGene界面中一樣。

　　5、對(duì)于開(kāi)發(fā)人員

　　要將SnapGene整合到您的數(shù)據(jù)分析或?qū)嶒?yàn)室管理軟件中，請(qǐng)聯(lián)系我們以獲取有關(guān)如何讀取和寫(xiě)入SnapGene文件的信息。

　　六、轉(zhuǎn)換文件格式

　　開(kāi)放式信息交換至關(guān)重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了讀取和導(dǎo)出常見(jiàn)文件格式的選項(xiàng)。

　　從其他格式導(dǎo)入時(shí)，目標(biāo)不僅是捕獲DNA序列，還捕獲注釋和注釋

　　新功能介紹

　　1、重疊群大會(huì)

　　線性或環(huán)狀重疊群可以從重疊序列或Sanger序列跡線重新組裝。

　　2、靈活的對(duì)齊

　　現(xiàn)在可以以各種方式導(dǎo)入要對(duì)齊的序列。可以提取多個(gè)對(duì)齊的一部分以生成新的多重對(duì)齊，或者可以編輯現(xiàn)有的多個(gè)對(duì)齊以添加或移除由不同算法生成的對(duì)齊。

　　3、Nicking Enzymes

　　可以顯示Nicking核酸內(nèi)切酶。當(dāng)選擇跨越從線性序列的末端到切口核酸內(nèi)切酶位點(diǎn)時(shí)，可以通過(guò)按Delete刪除該單鏈區(qū)域。

　　4、點(diǎn)特征

　　現(xiàn)在，DNA序列支持零長(zhǎng)度點(diǎn)功能，并在從GenBank，MacVector或Gene Construction Kit導(dǎo)入文件時(shí)識(shí)別。

　　5、酶網(wǎng)站突出顯示

　　常用的酶位點(diǎn)可以用黃金突出顯示，以便快速識(shí)別。

　　6、協(xié)調(diào)一致性增強(qiáng)

　　多重比對(duì)的共識(shí)序列具有改進(jìn)的格式，現(xiàn)在可以復(fù)制或?qū)С觥?/p>

　　7、用于與參考序列對(duì)齊的存儲(chǔ)編輯

　　根據(jù)流行的需求，當(dāng)通過(guò)調(diào)整比對(duì)序列的端點(diǎn)編輯與參考DNA序列的比對(duì)時(shí)，保留和恢復(fù)那些編輯。

　　8、從其他文件格式導(dǎo)入功能

　　可以將特征導(dǎo)入到BED，GFF3或GTF格式的DNA序列中。

　　9、從UniProt導(dǎo)入

　　可以從UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)入蛋白質(zhì)序列記錄。

　　10、進(jìn)口基因組編譯器項(xiàng)目

　　現(xiàn)在可以在SnapGene中直接打開(kāi)Genome Compiler項(xiàng)目文件（。gcproj）。對(duì)于施工項(xiàng)目文件，在“歷史記錄”視圖中捕獲施工歷史。

　　11、引物添加日期

　　將引物添加到文件時(shí)，會(huì)記錄日期。引物可按添加日期排序。

　　12、讀取和寫(xiě)入對(duì)齊文件格式

　　SnapGene可以將對(duì)齊導(dǎo)入SAM / BAM和VectorNTI?.cep格式的參考序列，并可以將對(duì)齊導(dǎo)出為SAM / BAM格式的參考序列。

【破解說(shuō)明】

　　1、雙擊SnapGene.exe，安裝軟件

　　2、軟件安裝完成后，直接替換SnapGene.exe

　　默認(rèn)路徑C:\Program Files （x86）\SnapGene

　　3、安裝破解完成，Enjoy

　　注冊(cè)信息無(wú)需理會(huì)，實(shí)際是已破解